Imágenes en blanco/negativo y negro

Quería preguntar si en las imágenes en blanco o negativo y en negro destinadas a impresión influye que el archivo sea PNG, TIF, PDF, etc.

Si, por supuesto. Por ejemplo, PNG es un formato que trabaja solo en RGB, por lo tanto se usa solo para web. Se puede imprimir compuesto, en una impresora de chorro de tinta o plotter, pero no sirve para imprenta.
TIF es una imagen de alta calidad, pero puede estar en RGB, CMYK o escala de grises, hay que tener cuidado de usar el formato correcto. De todas maneras no es lo aconsejable para un logo, primero porque son archivos pesados, segundo que es una imagen, como tal no puedes aplicarle trapping, sobreimpresiones, etc que son esenciales para imprimir correctamente.
Lo ideal es PDF, pero PDF vectorial, es decir hecho en un programa vectorial como CorelDRAW o Illustrator. Si guardas como PDF desde Photoshop el resultado será como colocar un JPG dentro de un archivo, será una imagen y no sirve para nada.

Recuerda que un logo puede ser blanco y negro, color CMYK/RGB o Pantone. Si usa colores Pantone la unica opcion es PDF vectorial. Un duotono de photoshop no da el mismo resultado (otra de las razones por las cuales un logo no se hace en Photoshop)

Ya que al ser color blanco, si no me equivoco no hay impresión en esa parte, ¿no? ¿Sería así y tendría el mismo efecto tanto en blanco como en negativo?

hay que tener claro que lo que se imprime es lo que está en negro. Si se invierte la imagen, se invierte lo que se imprime pero siempre se imprime lo negro, sea del color que sea. Lo blanco es el papel

¿Sería así y tendría el mismo efecto tanto en blanco como en negativo? El negativo se obtiene invirtiendo los colores.

Una cosa es invertir una foto, que se hace como negativo y otra cosa es la version negativa de un logo. Muchos logos no funcionan simplemente invirtiendo los colores. Algunos tienen una version negativa, que es especifica y desarrollada en el manual de identidad.

Y en el caso del negro es siempre color de registro, ¿no?

No, NUNCA es el color de registro.
El color negro es negro. Si es RGB,NegroRGB. Si es CMYK es solo 100% Negro C0 M0 Y0 K100, a eso se le llama "negro puro". El "negro enriquecido" -agregando porcentajes de las otras tintas- solo se usa en un fondo de gran tamaño. El color de registro sería un 100% de todas las tintas en uso en el archivo (CMYK y Pantone) y un logo, como cualquier otro diseño no debe tener nunca el 100% de las cuatro tintas CMYK. Ese color, como su nombre lo indica se usa solo para crear las marcas de Registro, que son pequeñas y extremadamente finas.

¿Los logos que no funcionan simplemente invirtiendo los colores es debido a que tienen otros colores aparte del negro, o no tiene que ver?

Gracias. Saludos.

No, no es por eso, es algo visual