Font Explorer X Pro Mac. Limpiar fuentes manteniendo las de Mac

Hola una vez más. Tengo una duda técnica con esta aplicación y bueno, a ver si me la resuelve alguien.

Trasteando con Fontexplorer en el mac, arrastre mis carpetas con tipos debajo de la parte en la que pone "set" y bueno, pensando que me haría un set por carpeta me las puso todas en el mismo.

Bien, mi intención es "borrar" esas tipos, todas, del programa, no del mac, por lo que buscando vi la opción "Clean System fonts folders..." y me dice algo así al aplicarlo: mi inglés es normalillo-bajo pero entiendo que limpiará del registro del programa todas aquellas tipos que no estuviesen instaladas con Mac Os y que si quiero, me moverá esas fuentes no instaladas a una carpeta, que imagino definiré yo mismo.

¿Eso quiere decir que las tipos que instala por ejemplo, photoshop y demás aplicaciones que tengo, se desinstalan? con lo que vería mis aplicaciones al arrancar con otras tipos, no?

¿Cómo haría para limpiar ese catálogo sin que afecte a mi carpeta donde tengo mis fuentes? Vamos, que se quede como cuando lo instalé (el fontexplorer eh) para poder arrastrr carpeta a carpeta de tipos y poder tener localizadas de manera mejor las tipografías.

Saludos....espero haberme explicado lo mejor posible...