Illustrator Problema con Pdf

Buenas tardes a todos/as.

Me llamo Jordi y tengo un problema serio que necesito solventar a la mayor brevedad posible. Resulta que un cliente me ha pasado 13 archivos en Pdf los cuales los veo correctamente tanto en mi lector de Pdf xomo en Photoshop. El problema viene desde la fabrica para la que trabajo desde la cual me dicen que al abrir los archivos en Illustrator para lanzarlas a la prensa digital Hp Indigo, les desaparece el fondo de los Pdf, colores y trazos. Alguien puede decirme por que y/o que podemos hacer para solvetarlo?? Os lo agradezco de antemano muchisimo. Gracias?!