¿No usar ID en selectores CSS?

Uso el editor Sublime Text 2 y como estoy empezando en desarrollo web vi perfecto añadirle el plugin CSS Lint que te marca el código con posible errores e indica sugerencias o precauciones a tener en cuenta. Me parece una idea perfecta pero me ha dejado perplejo que "me oblige" a no usar ID en los selectores con el aviso: "Don't use IDs in selectors".

Entonces he googleado y he encontrado esta discusión y esta otra.

¿Que les parece esto de no usar los ID? Después de no se cuantos videotutoriales y blogs si algo me había quedado clarísimo era la facilidad de usar los identificadores y las clases.

Aprovecho para pedir si alguien sabe como puedo aprender a crear bien mis CSS. Soy diseñador gráfico y llevo unas semanas con mi primer proyecto web y he usado muchos ID para identificar los elementos y según lo de arriba no se si corregirlo todo.

Por cierto, llevo 615 líneas de CSS para 3 páginas y parece de todo menos zen code ¿esto es normal?

Muchas gracias