Añadir marca de agua y rasterizar pdf con php

Hola ...
con PHP puedes crear PDFs desde cero y añadirles marca de agua, con una librería como esta
http://www.tcpdf.org
Pero si quieres re-procesar un PDF que ya existe, con PHP puro no se puede hacer, tienes que apoyarte en una librería externa, y claro puedes ejecutar esa librería desde PHP ...
http://www.ghostscript.com

entiendo que lo que quieres es añadir marcas de agua a PDFs que ya tienes y que quieres que sea un proceso automático ...
en Acrobat Profesional se puede hacer una acción que añada marcas de agua a todos los archivos que selecciones, en MAC con Automator se puede hacer la misma acción,
con Latex también se pueden re-procesar PDFs y añadirles marca de agua ...

Saludos !!

Gracias de antemano.
Te explico me gustaría crear una carpeta de entrada de pdf y otra de salida.
La carpeta de entrada podrá al pdf la marca de agua y las rasterizará y después pasará a la carpeta de sálida para publicarla.
Sé que se puede hacer en Acrobat con macros pero tengo que pararme más y necesitaría automatizarlo.

Aqui te dejo un script que uso para crear hot folders, esto busca archivos de ciertas extensiones y cuando los encuentra, los procesa y los guarda en una carpeta de salida ... (no está incluida la parte de procesar el archivo)
https://gist.github.com/feliper/11330170

Está en Ruby, y en el codigo está explicado como funciona,
saludos !!

Muchas gracias feliper! Es una pasada