Problemas de pérdida de peso al guardar los archivos NEF a JPEG en Photoshop

Hola a tod@s, me ha surgido un problema con Photoshop desde ayer que no puedo resolver, a ver si me pudierais ayudar.
Normalmente suelo editar las fotos primero en Camera Raw (archivos NEF) y de ahí los abro en Photoshop y continúo con los ajustes necesarios que me falten para luego guardarlos en JPEG, sin problemas. Ayer me empezó a ocurrir que al aplicar varias capas de ajustes y guardarlos el archivo se reducía en peso a 2 megas. Si no le aplicaba las capas de ajustes se me guardaba con 5 ó 6 megas, dependiendo del peso inicial.
Borré el archivo de preferencias de photoshop, pero seguí realizando la misma operación. Tengo un Mac, pero no tengo Time Machine. Restauré también las opciones de Camera Raw, pero nada, e incluso me bajé la versión CC de Photoshop, ya que uso CS6, pero no hay manera. Comprobé perfiles de color, cambié el modo de imagen a 16 Bits/canal, y ya no se me ocurre qué más hacer, la verdad.
No sé si a alguien le ha pasado ó si podríais darme alguna sugerencia más.

Un saludo, y gracias.